Il est tout à fait normal qu'un poulain mange ses crottins, car il se constitue ainsi une flore intestinale. C'est la même chose pour un cheval ayant subi une antibiothérapie. Pour les autres cas, il peut s'agir simplement d'une envie passagère de récupérer des grains présents dans les crottins.
Par contre, si cet agissement devient habituel, il peut s'agir soit d'un trouble du comportement, soit d'une carence alimentaire. Le plus simple est alors dans un premier temps de lui laisser à volonté un bloc de sels minéraux. Si le problème persiste, il faut envisager de faire venir le vétérinaire pour faire des analyses plus poussées.